分子水素結合ポテンシャル（MHBP）の開発と構造-透過性相関への応用

要約

本研究では、分子リポフィリシティポテンシャル（MLP）の生成手法を参考に、三次元水素結合特性を探索する計算ツール「分子水素結合ポテンシャル（MHBP）」を構築した。溶媒変色パラメータを出発点としたフラグメント系を開発し、極性部位の各水素原子にドナーフラグメント値（α）、各極性原子にアクセプターフラグメント値（β）を割り当てた。距離関数および角度関数を定義して空間的変動を考慮し、分子表面または三次元グリッド上でMHBPを算出した。GRIDエネルギーとの比較および経口薬物吸収データとの相関解析により、MHBPが創薬設計における有望な計算ツールであることが示された。

メカニズム

溶媒変色パラメータ由来のフラグメント値（α・β）に距離・角度関数を組み合わせ、分子表面上の水素結合ポテンシャルを三次元的に算出する手法を構築した。