レスベラトロールとメチル-CpG結合タンパク質との相互作用：分子ドッキングおよびMDシミュレーションによる解析

要約

レスベラトロールはBRCA1遺伝子発現を促進し、MBDファミリータンパク質はBRCA1プロモーター領域に結合する。本研究では分子ドッキングにより、レスベラトロールがMeCP2タンパク質に対して最も高い結合親和性（ΔG = -6.5）を示し、4本の水素結合を形成することが示された。MDシミュレーションでは75 ns以降に複合体が安定化し、MBD1、MBD2、MeCP2の骨格偏差はそれぞれ0.4 Å、0.5 Å、0.7 Åで推移した。結合自由エネルギーはMeCP2複合体で-94.764 kJ/molと最大であり、MBDタンパク質が各種がん関連シグナル経路に関与することも示唆された。

メカニズム

レスベラトロールはMeCP2タンパク質と4本の水素結合を形成し、結合自由エネルギー-94.764 kJ/molで最も安定な複合体を構成することで、BRCA1プロモーター領域の制御に関与する可能性がある。