バイカル湖低温堆積物から単離されたThermaerobacter属初の通性独立栄養性好熱菌のゲノム解析

要約

ロシア・バイカル湖のPosolsk Bankメタン湧出域近傍の低温表層堆積物から、Thermaerobacter属の新規菌株PB12/4term（=VKM B-3151）が単離された。本菌株は分子状水素を電子供与体、元素硫黄およびチオ硫酸塩を電子受容体、CO/CO₂を炭素源として利用する通性独立栄養性を示す。ゲノムサイズは2,820,915 bp、G+C含量は72.2%であり、120種の保存的単コピータンパク質に基づく系統ゲノム解析によりFirmicutes_E門Thermaerobacteria綱に分類された。[NiFe]ヒドロゲナーゼ遺伝子の存在が独立栄養的増殖を可能にしており、近縁種には同酵素が欠如していることが確認された。

メカニズム

菌株PB12/4termは[NiFe]ヒドロゲナーゼを保有し、分子状水素を電子供与体として硫黄化合物を還元することで独立栄養的増殖を実現する。